אחד מתפקידיה של הממונה הוא מניעת הטרדות מיניות במשרד החינוך כלפי עובדות המשרד ועובדיו, ושימוש כתובת לפניות בנושא. לצד הממונה על השוויון המגדרי עומדות ממונות מחוזיות, והן אחראיות למניעת הטרדה מינית במחוזות השונים של המשרד, כלומר הן הכתובת לייעוץ ולהדרכה עבור העובדות והעובדים והן הכתובת לפנייה ולתלונות על הטרדה מינית במקום העבודה.
הממונה הישירה במחוז מקבלת את הפנייה, רושמת את הפנייה ומחתימה את הפונה על הרישום, תוך הבהרת אפשרויות הטיפול וחובת ההעברה של התלונה לממונה הארצית ולנציבות שירות המדינה.
על הממונה חלה חובה להעביר דיווח לממונה הארצית ולנציבות, אולם פרטי התלונה, ובכללם זהות המתלונן או המתלוננת, נותרים חסויים ומובאים לידיעת מספר אנשים מצומצם ביותר: בתוך המשרד רק הממונה הארצית ובנציבות – שלושה גורמי טיפול. כל אלה מחויבים לשמור על סודיות ועל דיסקרטיות מרבית.
